秦淮在白檀过了一把“弹指千军破，扬马疆万里。”的瘾。野心膨胀到极点，如果不是刚刚获得大块地盘，怕是想要起兵把刘宏拉下马。
但是这也只能想想就算了，中原人才济济，无论是人口基数还是资源，大汉朝是碾压秦淮的，瘦死的骆驼比马大，历史上董卓的势力可不比秦淮差，秦淮自认自身能力比董肥肥差得多。
路漫漫其修远兮，搞坏大汉这个光荣而艰巨的任务就只能交给董老板了，要想取得天下可不能当出头鸟，只会把自己搞臭，成为众矢之的。
颍川战场的主帅是波才，刘宏派遣右中郎将朱隽攻击波才，波才击杀了汝南太守赵谦，击败了朱隽，将朱隽围困在长社。大汉另一位中郎将皇甫嵩前来支援朱隽，进驻长社。
波才围攻长社，兵力多于汉将皇甫嵩，汉军十分恐惧。波才依靠草地结扎营寨，被皇甫嵩发现，恰巧这天大风不止，皇甫嵩便奇袭波才营寨，纵火焚烧，波才军溃退。大汉骑都尉曹操正好前来救援皇甫嵩等人，便会合皇甫嵩，击破波才。波才军伤亡数万人，波才退走阳翟。
不能怪波才不行，汉军两大名将都在他手上吃亏，波才是孤军奋战，至少没有一个强有力的外援，而汉军源源不断。
皇甫嵩等人于长社胜利后，乘胜追击，于阳翟击破波才，又在西华击破了彭脱。波才、彭脱失败后，东方的黄巾军势力便被摧毁。剩下一些零星黄巾也躲山里做山贼，比如刘辟、龚都、何曼、何仪等。
南方军黄巾主将“神上使”张曼成，在起义初始阶段势力也一度发展到数十万人，还杀死南阳太守褚贡，不过被新任太守秦颉击败。张曼成牺牲，义军推举赵弘为帅，势力发展到10余万，并据守宛城。皇帝刘宏派遣朱儁与荆州刺史徐璆及秦颉等合兵1.8万人围攻义军宛城义军，从六月至八月都没有攻下来。后来朱儁猛攻宛城，赵弘迎战直接战死；义军又推举韩忠为帅，仍然坚守宛城抵抗朱儁。朱儁偷袭宛城成功后，韩忠只能退保小城。朱儁又是猛攻，但人马疲惫，久攻不下；朱儁假装撤去包围，韩忠出城而战，朱儁伏兵齐出韩忠兵败，战死数万人。韩忠投降，被秦颉斩杀。义军之中再次推举孙夏为渠帅，也是占据宛城。朱儁似乎不给黄巾军喘息的机会，猛击城池，11月宛城再次被攻破，孙夏带兵逃跑；朱儁追兵在西鄂精山追上孙夏残军，再次击败孙夏，义军上万人被杀，其余逃散。南阳黄巾不复存在。
和历史上不一样的是汉军只有少部分被带回雒阳，其余人被解散，但是地方被战争破坏，哪里还有生活的地方，没错落草为寇，为大汉的破碎增加助力，皇帝也没办法，雒阳被秦淮搜刮了一遍，刘宏气得要死，都派出好几波探子了，还有倒霉蛋吕布，莫名其妙遭遇刺客，而且还是好几次，而且还有的是匈奴人。吕布几次被刺杀抓到刺客审问得到一个惊人消息，“皇帝陛下刘宏要对付他。”吕布以为是他攻击护乌桓中郎将秦淮的事被皇帝知晓想要搞他，吕布只好带亲信逃亡到凉州，吕布和董卓看对了眼，提前成了董卓的义子。
连连征战让本来就病重的大汉摇摇欲坠，地方黄巾余孽作乱不断，根本无法从根本上剿灭。经历了黄巾之乱、凉州叛乱等大规模战乱之后，整个东汉帝国处在风雨飘摇之中，地方郡县长官凭借征讨叛乱时招募的武装拥兵自重，中央对地方的控制力大不如前。黄巾之乱虽已过去，但明眼人都看得出，东汉帝国更大的危机不久就将到来。
汉室宗亲刘焉提出了州牧制，刘焉提出的时机正是地方郡太守拥兵自重，私人武装渐成尾大不掉态势，刘焉主张（表面上）设立州牧，可以在各郡之上增设州级行政机关，可以强化对这些地方豪强的管控。只有监察权的刺史显然确实已经不适应当时的社会情况，所以刘焉特别强调以“清名重臣”去担任州牧，来镇抚、管控各郡。
表面上刘焉的提议确有其道理，不过在当时情况下，州牧的存在只能是一种悖论：郡级官员拥兵自重，就设立州级官员压制；州级官员也拥兵自重，谁来压制？
显然，从后世观察，汉末的州牧绝大多数恰恰成为整合各郡小豪强的大军阀，正是这些大军阀之间的战争将东汉彻底撕裂。而汉末第一位州牧，就没带好头，正是这位提议设立州牧的刘焉，到任后大搞割据，给后来者做了个“最佳示范”。
就在汉灵帝犹豫时，传来一些报告，称益州此时郤俭在当地胡作非为，有关他的非法勾当谣言四起。而并州刺史张懿、凉州刺史耿鄙则接连被反贼杀害。一系列的事件似乎冥冥中在帮助刘焉，向汉灵帝证明着刺史制度亟需修改，需要忠诚的朝中大臣空降地方，放手给他们权力去地方上拨乱反正。
《三国志·刘焉传》载：会益州刺史郤俭赋敛烦扰，谣言远闻，而并州杀刺史张壹，凉州杀刺史耿鄙，焉谋得施。
汉灵帝最终采纳刘焉提议，第一批任命了三个州牧：益州牧刘焉、豫州牧黄琬、幽州牧秦淮，秦淮灭乌桓，迫降东部鲜卑，还给刘宏奉献白马100匹、黄金千两、白银万两、还有十名金发碧眼的洋鬼子美女。
秦淮的举措对于刘宏真是雪中送炭，赞美秦淮是肱股之臣，为官之楷模，又赶上刘焉提议州牧制。秦淮不光成为幽州牧，还封蓟侯，朝廷不少大臣反对，觉得秦淮太年轻又拥兵自重，不宜掌握太多权柄，刘宏也一度动摇，但是刘宏国库空虚，想要找那些大臣支援一点，一个个就三缄其口，仿佛不认识刘宏，刘宏认清了他们的嘴脸，认为还是秦淮忠心，至少能为皇帝分忧，平定边患，还会做人，缓皇帝的燃眉之急。
单说刘焉，作为州牧制度提议者，汉灵帝自然报以厚望，加封其为阳城侯，授其监军使者权力，以便让他去捉拿横征暴敛的益州刺史郤俭。
刘焉出发前，之前提到的董扶请求担任蜀郡属国都尉跟随刘焉，太仓令巴西郡人赵韪更是辞去官职跟随刘焉入蜀。这里的蜀郡属国，并非真正的“国”，而是少数民族归附的聚居地，级别相当于郡，蜀汉建立后此地改设汉嘉郡。赵韪在刘焉集团地位非常重要，该人在后续文章中还将有进一步介绍。
刘焉以州牧身份前往益州，本意是远离中原躲避战祸，而且据董扶所言益州有“天子气”，可行至荆益边界却发现道路已被封死，益州最高长官竟然无法踏足益州。
原来，有一伙自称黄巾军的叛军在益州境内起兵，为首二人叫马相、赵祗。当时益州百姓生活状态也不比中原好多少，二人振臂一呼两天内就募得数千人，他们迅速攻杀绵竹县令李升，又攻破雒县杀死郤俭，替刘焉把目标任务给完成了。一个月之内，这伙益州黄巾军连破三郡，聚众多达数万，马相趁机自称天子。
面对如此多叛军，刘焉完全没办法。幸好有位益州从事贾龙，带领数百士兵在犍为东部边界据守，聚拢逃往的官员百姓后，扩充了一千多人的部队。贾龙带领这支部队反攻叛军，把刚称帝没几天的马相赶跑，很快平定了这场叛乱。
赶跑叛军后贾龙便派人迎接刘焉，这样，益州牧刘焉在本地士人的热烈欢迎中正式进入蜀地，然而，刘焉回报给贾龙等本地大族的，却不是信任与合作，而是铁和血。
秦淮整合好了势力后，努力发展农业和商业，对于地方豪强，采取拉拢一方，打压一方；文官不足就实行军管，让权利集中在太守的手里，治安由军队维持，但异地郡府会每日相互巡逻兼管，百姓可以异地反馈地方问题，也可以找本地官方解决；税收方面则是异地执行，由州牧府派人先统计。
幽州还派军队帮助百姓开垦土地，足量分配给百姓，禁止私自买卖土地，有多余土地的可以到郡县备案，由官家高价收购，有私自买卖土地者，郡守都会被要严惩，买家会被抄家灭族；其次鼓励发展商业，这样经历发展相对稳定，地方豪强门下一些佃户逐渐脱离开来，土地兼并已经无法达到强大家族的目的，一些有头脑的家族去发展商业，幽州牛羊最多，从官府批发再贩卖到其它州郡，赚的盆满钵满，一些顽固的豪强起兵反抗，则被轻松灭了族，土地被官方回收。
秦淮的做法确实得罪了很多人，也让很多人才流失，但得到了百姓的支持，现在百姓富足，如果有人去搞破坏，可以想象后果，那就是和幽州百姓为敌，再看看幽州以外的州郡，哪里有幽州稳定，哪里的百姓能有幽州安居乐业。
